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Volume 19, Number 9—September 2013

Research

Continued Evolution of West Nile Virus, Houston, Texas, USA, 2002–2012

Brian R. Mann1, Allison R. McMullen1, Daniele M. Swetnam, Vence Salvato, Martin Reyna, Hilda Guzman, Rudy Bueno, James A. Dennett, Robert B. Tesh, and Alan D.T. BarrettComments to Author 
Author affiliations: University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas, USA (B.R. Mann, A.R. McMullen, D.M. Swetnam, H. Guzman, R.B. Tesh, A.D.T. Barrett); Harris County Public Health and Environmental Services, Houston, Texas, USA (V. Salvato, M. Reyna, R. Bueno, Jr., J.A. Dennett)

Main Article

Table 2

Conserved amino acid substitutions in West Nile virus isolates, Harris County, Texas, USA, 2002–2012*

C prM E NS1 NS2A NS2B NS3 NS4A NS4B NS5
104
156
159
460
236
52
90
95
188
120
180
334
85
14
24
240
49
314
NY99
1999
K
V
V
I
I
T
M
L
R
V
E
S
A
S
K
I
V
K
1 TX114 2002 · · A · · · · · · · · · · · · · · ·
TX1153 2003 · I A · · · · · · · · · · · · · · ·
2 v4369 2003 · · A · · · · · · · · · · · · · · ·
3 TX1175 2003 · · A · · · · · · · · · · · · · · ·
4 M37906 2009 · · A L · · · · · · · · · · · M · ·
M38488 2009 · · A L · · · · · · · · · · · M · ·
M20140 2009 · · A L · · · · · · · · · · · M · ·
5 TX7558 2008 · · A · · · · · · · · · T · · · · ·
TX6647 2007 · · A · · · V · · · · · T · · · · ·
TX8349 2011 · · A · · · · F · · · · T · · · · ·
M19433 2007 · · A · · · · · · · · · T · · M · R
6 TX 2002 1 2002 · · A · · · · · · · · · · · · M · ·
TX5810 2006 · · A · · · · · · · · · · · · M · ·
7 TX7827 2009 · I A · · · V · · · · · · · · · · ·
TX8092 2010 · · A · · · V · · · · · · · · · · ·
8 TX1461 2003 · · A · · · · · · · D · · · · · · ·
TX8599 2012 · · A · · · · · · · D · · · · · · ·
9 TX8559 2012 · · A · · I · F · · · T · I · · · ·
10 TX6276 2006 · · A M · · · · · · · · · · · M · ·
TX8589 2012 · · A · · · · · K · · · · · · M · ·
TX8590 2012 R · A · V · · · K I · · · · · · I ·
TX8551 2012 R · A · V · · · K I · · · · R · I ·

*G, group; C, capsid; prM, premembrane; E, envelope; NS, nonstructural. Amino acid changes are relative to the prototype NY99 strain AF196836. Substitutions characteristic of defined NA/WN02 and SW/WN03 genotypes are indicated in boldface. Dots indicate no change from the NY99 isolate.
†Indicated substitutions conserved in >1 representative isolate for each of the proposed phylogenetic groups (see Figure 1).

Main Article

1These authors contributed equally to this article.

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