Volume 16, Number 12—December 2010
Dispatch
Characterization of Nipah Virus from Naturally Infected Pteropus vampyrus Bats, Malaysia
Table 2
Summary of deduced amino acid changes in the N, P, M, F, G, and L proteins of NiV from Pteropus vampyrus bats compared with other NiV isolates*
Isolate† |
N, aa position |
P, aa position |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NiV isolate | 429 | 432 | 457 | 41 | 140 | 195 | 295 | 304 | 309 | 408 | 410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. vampyrus | V | E | D | R | A | P | S | A | T | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human-CDC | I | G | N | Q | T | L | N | T | A | T | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. hypomelanus | I | G | N | Q | T | L | N | T | A | T | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pig-Tambun | I |
G |
N |
Q |
T |
L |
N |
A |
A |
T |
A |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
P, aa position |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NiV isolate | 412 | 419 | 420 | 425 | 427 | 430 | 437 | 438 | 439 | 440 | 454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. vampyrus | N | K | M | R | G | P | P | P | Q | S | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human-CDC | Y | N | V | S | A | H | Y | Q | E | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. hypomelanus | Y | N | V | S | A | H | Y | Q | E | G | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pig-Tambun | Y |
N |
V |
S |
A |
H |
Y |
Q |
E |
G |
T |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
P, aa position |
M, aa position |
F, aa position |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NiV isolate | 463 | 464 | 467 | 468 | 471 | 664 | 147 | 234 | 331 | 11 | 63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. vampyrus | K | I | P | H | N | V | G | Y | V | S | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human-CDC | E | V | V | D | D | I | S | S | I | C | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. hypomelanus | E | V | V | D | D | I | S | S | I | C | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pig-Tambun | E |
V |
V |
D |
D |
I |
G |
S |
I |
C |
P |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
F, aa position |
G, aa position |
L, aa position |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NiV isolate | 460 | 20 | 186 | 426 | 444 | 470 | 481 | 223 | 1645 | 1753 | 2039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. vampyrus | K | N | D | I | V | Q | D | N | F | V | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human-CDC | I | I | N | V | I | L | N | T | S | M | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
P. hypomelanus | I | I | N | V | I | L | N | T | F | M | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pig-Tambun | I | N | N | V | I | L | N | N | F | V | N |
*N, nucleocapsid; P, phosphoprotein; M, matrix; F, fusion, G, attachment; L, polymerase; NiV, Nipah virus; CDC, Centers for Disease Control and Prevention. Boldface indicates amino acid changes.
†GenBank accession nos.: NiV Human-CDC , AF212302; NiV P. hypomelanus, AF376747; NiV Pig-Tambun, AJ627196.
1Members of the Henipavirus Ecology Research Group are listed on the group’s website (www.henipavirus.org/staff/Staff.htm).