Volume 17, Number 3—March 2011
Research
Monitoring and Characterization of Oseltamivir-Resistant Pandemic (H1N1) 2009 Virus, Japan, 2009–2010
Makoto Ujike, Miho Ejima, Akane Anraku, Kozue Shimabukuro, Masatsugu Obuchi, Noriko Kishida, Xu Hong, Emi Takashita, Seiichiro Fujisaki, Kazuyo Yamashita, Hiroshi Horikawa, Yumiko Kato, Akio Oguchi, Nobuyuki Fujita, Masato Tashiro, Takato Odagiri
, and the Influenza Virus Surveillance Group of Japan
, and the Influenza Virus Surveillance Group of Japan
Table A1
Amino acid difference(s) of OR (n = 61) from OS (n = 190) pandemic (H1N1) 2009 virus consensus sequences in neuraminidase protein*
| Strains | Amino acid difference(s) of neuraminidase protein |
||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15 |
16 |
34 |
40 |
41 |
43 |
80 |
82 |
83 |
85 |
86 |
95 |
98 |
106 |
138 |
154 |
166 |
195 |
222† |
234 |
248 |
257 |
269 |
275 |
286 |
289 |
382 |
386 |
416 |
430 |
452 |
|
| M | T | I | L | G | Q | V | S | V | L | A | S | A | I | A | P | V | I | A | V | D | R | M | Y | S | T | G | N | D | R | T | |
| A/Niigata/1459/2009 | E‡ | Y/H§ | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Hiroshima/590/2009 | E | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shizuoka-C/270/2009 | E | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tochigi/471/2009 | E | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yokohama/1340/2009 | E | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Niigata/10016/2009 | E | R | Y | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Aichi/1210/2009 | P | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Kobe/92495/2009 | P | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Mie/100/2009 | P | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Saitama/374/2009 | P | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Wakayama/318/2009 | P | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yamaguchi/248/2009 | P | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yamanashi/847/2009 | P | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yokohama/1563/2009 | P | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Fukuoka/1/2010 | M | P | Y | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yamagata/29/2010 | P | T | N | Y | |||||||||||||||||||||||||||
| A/Wakayama-C/1/2010 | P | T | Y/H | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Niigata/10019/2009 | P | A | Y | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Osaka/180/2009 | N | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Oita/126/2009 | I | V | N | Y | G | ||||||||||||||||||||||||||
| A/Shizuoka-C/172/2009 | G | V | N | Y | |||||||||||||||||||||||||||
| A/Osaka/2191/2009 | I | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tochigi/609/2009 | I | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tochigi/612/2009 | I | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Hokkaido/256/2009 | Y/H | N | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shizuoka-C/247/2009 | Y | N | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Wakayama/291/2009 | Y | N | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shiga/45/2009 | F | Y | N | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Sapporo/576/2009 | S | V | Y | N | |||||||||||||||||||||||||||
| A/Yokohama/1538/2009 | V | Y/H | N | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/FUKUI/159/2009 | Y | E | N | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Osaka/2024/2009 | I | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shiga/43/2009 | V | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Aichi/1166/2009 | K | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Sapporo/31/2010 | M | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shimane/1062/2009 | F | Y/H | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Saitama/396/2009 | T | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shiga/61/2009 | I | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shizuoka/1380/2009 | K | Y | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Hyogo/2003/2009 | K | Y | I | ||||||||||||||||||||||||||||
| A/Osaka/2143/2009 | Y | I | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Mie/137/2009 | Y/H | D | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tochigi/373/2009 | Y/H | D | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Aichi/1019/2009 | Y | Q | |||||||||||||||||||||||||||||
| A/Chiba/1017/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Fukushima/452/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Iwate/3/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Kitakyusyu/4/2010 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Miyazaki/111/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Niigata/1233/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Niigata/1234/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Niigata-C/186/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Saitama/408/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Saitama-C/88/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Sapporo/190/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Shimane/188/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tokushima/2/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Tottori/225/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yamagata/534/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yamaguchi/22/2009 | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
| A/Yokohama/1394/2009 |
Y/H |
||||||||||||||||||||||||||||||
| *OR, oseltamivir resistant; OS, oseltamivir susceptible. †Recent OR seasonal influenza A (H1N1) isolates have R222Q and V234M mutations that would restore viral fitness (23). ‡Of 190 pandemic (H1N1) 2009 virus isolates, G41E, S82P, D248N, M269I, and D416N were observed from 4, 10, 27, 0, and 17 OS pandemic (H1N1) 2009 virus isolates, respectively. §Mixed population of H275 and Y275. | |||||||||||||||||||||||||||||||
1Members of the Influenza Virus Surveillance Group of Japan are listed at the end of this article.
Page created: July 25, 2011
Page updated: July 25, 2011
Page reviewed: July 25, 2011
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